Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vmn1r44Q9EQ47 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmn1r44Q9EQ47 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106 ms