Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Cxcr6Q9EQ16 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cxcr6Q9EQ16 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms