Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tlr1Q9EPQ1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tlr1Q9EPQ1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tlr1Q9EPQ1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Tlr1Q9EPQ1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tlr1Q9EPQ1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tlr1Q9EPQ1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms