Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL6

Mmp1b, Interstitial collagenase B, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1bQ9EPL6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mmp1bQ9EPL6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp1bQ9EPL6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms