Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ap3s1Q9DCR2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms