Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc38a3Q9DCP2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc38a3Q9DCP2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms