Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rnft1Q9DCN7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnft1Q9DCN7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms