Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Eif3fQ9DCH4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Eif3fQ9DCH4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms