Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Xab2Q9DCD2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Xab2Q9DCD2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms