Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Med29Q9DB91 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Med29Q9DB91 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms