Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Pop5Q9DB28 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Pop5Q9DB28 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Pop5Q9DB28 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Pop5Q9DB28 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Pop5Q9DB28 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Pop5Q9DB28 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pop5Q9DB28 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Pop5Q9DB28 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Pop5Q9DB28 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Pop5Q9DB28 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Pop5Q9DB28 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Pop5Q9DB28 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pop5Q9DB28 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pop5Q9DB28 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pop5Q9DB28 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pop5Q9DB28 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pop5Q9DB28 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pop5Q9DB28 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pop5Q9DB28 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pop5Q9DB28 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pop5Q9DB28 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pop5Q9DB28 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pop5Q9DB28 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pop5Q9DB28 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pop5Q9DB28 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pop5Q9DB28 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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