Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms