Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z1

Knstrn, Small kinetochore-associated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KnstrnQ9D9Z1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KnstrnQ9D9Z1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KnstrnQ9D9Z1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms