Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pdzd9Q9D9M4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzd9Q9D9M4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms