Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9H8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D9H8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D9H8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q9D9H8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Q9D9H8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9D9H8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D9H8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q9D9H8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms