Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldnd2Q9D9H2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cldnd2Q9D9H2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms