Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmco5aQ9D9D5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco5aQ9D9D5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms