Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D8N1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D8N1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8N1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8N1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8N1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8N1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8N1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8N1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8N1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D8N1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D8N1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8N1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8N1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q9D8N1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms