Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms