Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nop56Q9D6Z1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nop56Q9D6Z1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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