Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc52a3Q9D6X5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slc52a3Q9D6X5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms