Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rtl8cQ9D6I0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Rtl8cQ9D6I0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rtl8cQ9D6I0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rtl8cQ9D6I0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8cQ9D6I0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Rtl8cQ9D6I0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl8cQ9D6I0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl8cQ9D6I0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rtl8cQ9D6I0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl8cQ9D6I0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rtl8cQ9D6I0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rtl8cQ9D6I0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rtl8cQ9D6I0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rtl8cQ9D6I0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rtl8cQ9D6I0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8cQ9D6I0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8cQ9D6I0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8cQ9D6I0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8cQ9D6I0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8cQ9D6I0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8cQ9D6I0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8cQ9D6I0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8cQ9D6I0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8cQ9D6I0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8cQ9D6I0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8cQ9D6I0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8cQ9D6I0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8cQ9D6I0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8cQ9D6I0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl8cQ9D6I0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl8cQ9D6I0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl8cQ9D6I0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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