Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttc9bQ9D6E4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms