Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab11fip1Q9D620 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab11fip1Q9D620 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms