Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc39Q9D5Y1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc39Q9D5Y1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc39Q9D5Y1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc39Q9D5Y1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc39Q9D5Y1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc39Q9D5Y1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc39Q9D5Y1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc39Q9D5Y1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc39Q9D5Y1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc39Q9D5Y1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms