Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PudpQ9D5U5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PudpQ9D5U5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms