Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Speer4f1Q9D5Q6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Speer4f1Q9D5Q6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms