Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
4930449I24RikQ9D5E3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930449I24RikQ9D5E3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms