Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn11Q9D572 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn11Q9D572 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn11Q9D572 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn11Q9D572 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn11Q9D572 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn11Q9D572 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ubxn11Q9D572 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn11Q9D572 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn11Q9D572 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn11Q9D572 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn11Q9D572 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn11Q9D572 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn11Q9D572 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn11Q9D572 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ubxn11Q9D572 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
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Ubxn11Q9D572 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ubxn11Q9D572 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms