Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sf3a3Q9D554 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sf3a3Q9D554 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms