Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Zcchc13Q9D548 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms