Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc7Q9D541 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc7Q9D541 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc7Q9D541 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc7Q9D541 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc7Q9D541 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc7Q9D541 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc7Q9D541 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc7Q9D541 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc7Q9D541 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc7Q9D541 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc7Q9D541 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc7Q9D541 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc7Q9D541 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc7Q9D541 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc7Q9D541 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc7Q9D541 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc7Q9D541 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc7Q9D541 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc7Q9D541 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc7Q9D541 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc7Q9D541 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc7Q9D541 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc7Q9D541 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc7Q9D541 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc7Q9D541 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc7Q9D541 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms