Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Gm3404Q9D506 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Gm3404Q9D506 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Gm3404Q9D506 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Gm3404Q9D506 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Gm3404Q9D506 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Gm3404Q9D506 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Gm3404Q9D506 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Gm3404Q9D506 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Gm3404Q9D506 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Gm3404Q9D506 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Gm3404Q9D506 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm3404Q9D506 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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