Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
4930556J24RikQ9D4U7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
4930556J24RikQ9D4U7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms