Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C1

Lmntd1, Lamin tail domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd1Q9D4C1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmntd1Q9D4C1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms