Protein–RNA interactions for Protein: Q9D498

Iqcf3, IQ domain-containing protein F3, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iqcf3Q9D498 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Iqcf3Q9D498 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Iqcf3Q9D498 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Iqcf3Q9D498 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Iqcf3Q9D498 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Iqcf3Q9D498 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Iqcf3Q9D498 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Iqcf3Q9D498 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Iqcf3Q9D498 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Iqcf3Q9D498 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Iqcf3Q9D498 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Iqcf3Q9D498 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Iqcf3Q9D498 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Iqcf3Q9D498 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Iqcf3Q9D498 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Iqcf3Q9D498 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Iqcf3Q9D498 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Iqcf3Q9D498 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Iqcf3Q9D498 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Iqcf3Q9D498 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Iqcf3Q9D498 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Iqcf3Q9D498 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Iqcf3Q9D498 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Iqcf3Q9D498 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Iqcf3Q9D498 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms