Protein–RNA interactions for Protein: Q9D485

Efhc2, EF-hand domain-containing family member C2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc2Q9D485 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efhc2Q9D485 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhc2Q9D485 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhc2Q9D485 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhc2Q9D485 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhc2Q9D485 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhc2Q9D485 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhc2Q9D485 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhc2Q9D485 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhc2Q9D485 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhc2Q9D485 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhc2Q9D485 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhc2Q9D485 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhc2Q9D485 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhc2Q9D485 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhc2Q9D485 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhc2Q9D485 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhc2Q9D485 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhc2Q9D485 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhc2Q9D485 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhc2Q9D485 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhc2Q9D485 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhc2Q9D485 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhc2Q9D485 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhc2Q9D485 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efhc2Q9D485 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efhc2Q9D485 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms