Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms