Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Snx29Q9D3S3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms