Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3N5

5430402E10Rik, RIKEN cDNA 5430402E10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
5430402E10RikQ9D3N5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
5430402E10RikQ9D3N5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms