Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Snx20Q9D2Y5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms