Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Snapc3Q9D2C9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Snapc3Q9D2C9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Snapc3Q9D2C9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Snapc3Q9D2C9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Snapc3Q9D2C9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Snapc3Q9D2C9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Snapc3Q9D2C9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Snapc3Q9D2C9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Snapc3Q9D2C9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Snapc3Q9D2C9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snapc3Q9D2C9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Snapc3Q9D2C9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Snapc3Q9D2C9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Snapc3Q9D2C9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snapc3Q9D2C9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snapc3Q9D2C9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snapc3Q9D2C9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snapc3Q9D2C9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snapc3Q9D2C9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snapc3Q9D2C9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snapc3Q9D2C9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snapc3Q9D2C9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snapc3Q9D2C9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Snapc3Q9D2C9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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Snapc3Q9D2C9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snapc3Q9D2C9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snapc3Q9D2C9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snapc3Q9D2C9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snapc3Q9D2C9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Snapc3Q9D2C9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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