Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D1F3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1F3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D1F3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D1F3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D1F3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D1F3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D1F3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9D1F3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms