Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl28Q9D1B9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms