Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm12Q9D0R8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm12Q9D0R8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms