Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I8

Mrto4, mRNA turnover protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrto4Q9D0I8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrto4Q9D0I8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrto4Q9D0I8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrto4Q9D0I8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrto4Q9D0I8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrto4Q9D0I8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrto4Q9D0I8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrto4Q9D0I8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrto4Q9D0I8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrto4Q9D0I8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrto4Q9D0I8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrto4Q9D0I8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrto4Q9D0I8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrto4Q9D0I8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrto4Q9D0I8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrto4Q9D0I8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrto4Q9D0I8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrto4Q9D0I8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms