Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc47Q9D024 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc47Q9D024 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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