Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Elp3Q9CZX0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Elp3Q9CZX0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Elp3Q9CZX0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Elp3Q9CZX0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Elp3Q9CZX0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Elp3Q9CZX0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Elp3Q9CZX0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Elp3Q9CZX0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Elp3Q9CZX0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Elp3Q9CZX0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Elp3Q9CZX0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Elp3Q9CZX0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms