Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rab3bQ9CZT8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3bQ9CZT8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms