Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZR8

Tsfm, Elongation factor Ts, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsfmQ9CZR8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TsfmQ9CZR8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TsfmQ9CZR8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TsfmQ9CZR8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TsfmQ9CZR8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TsfmQ9CZR8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TsfmQ9CZR8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TsfmQ9CZR8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TsfmQ9CZR8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TsfmQ9CZR8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TsfmQ9CZR8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TsfmQ9CZR8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TsfmQ9CZR8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TsfmQ9CZR8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TsfmQ9CZR8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TsfmQ9CZR8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TsfmQ9CZR8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TsfmQ9CZR8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TsfmQ9CZR8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms